Написала заявление об увольнении по собственному желанию,а уволили за прогул

Работала в организации,надлежащим образом исполняла свои обязанности,претензий со стороны руководителя за всё время работы не было.Официальной зарплатой был МРОТ,но была устная договоренность о дополнительном доходе,по истечении продолжительного времени,то что я дополнительно заработала,мне так и не выплатили.После того,как я в очередной раз попросила вернуть заработанные деньги и,мне отказали, я написала заявление об увольнение по собственному желанию.Позвонила по телефону руководителю,предупредила об увольнение,произошел конфликт и,она мне сказала,что я могу уходить прямо в этот же день. Спустя две недели она мне выслала трудовую книжку с записью "уволена за однократное грубое нарушение (прогул)".Дата на моем заявление стояла 21,09, а запись в трудовой 28.09.Проблема в том,что мой непосредственный руководитель в данной организации никем не является,числится только учредителем организации,а директор подставное лицо.Более того,у данного руководителя не одна такая организация и,юридические адреса не совпадают с местом нахождения моего рабочего места.Т.е. когда я писала заявление на увольнение,то оставила его на своем рабочем месте,а подпись о принятии заявления поставила сотрудница другой организации,которая работала вместе со мной в одном офисе,под началом того же руководителя (по сути той же в которой работаю я).Своего настоящего руководителя я никогда не видела,все записи в трудовой заполнялись моим непосредственным руководителем.Более того,заявление на увольнение я направила факсом своему непосредственному руководителю,а также неоднократно пыталась выяснить юридический адрес организации,чтобы направить это заявление почтой,естественно мне отказали.Что я могу сделать в этой ситуации и,достаточно ли у меня оснований для подачи искового заявления в суд об изменении записи в трудовой книжке.